尽管对公账户办理POS机具有一定的便捷性，但仍存在一些限制因素。具体来说，主要包括以下几个方面：

资质要求：商家在申请POS机时，需要提供对公账户、营业执照、税务登记证等相关资质证明。这些资质的齐全与否，将直接影响POS机的申请成功率。

信用评估：银行与支付机构在审批POS机申请时，会对商家的信用状况进行评估。若商家存在不良信用记录，如逾期还款、欺诈行为等，将可能导致申请被拒。

行业限制：部分高风险行业，如赌博、色情等，可能无法办理POS机。这是因为这些行业存在较高的欺诈与洗钱风险，银行与支付机构为了保障资金安全，通常会对其进行限制。

交易限额：为了控制风险，银行与支付机构会对POS机的交易限额进行设置。商家在使用POS机时，需遵守这些限额规定，否则可能导致交易失败或账户被冻结。